黃璐琦1992年報考了北京醫(yī)科大學(xué)的博士研究生，師從樓之岑院士、誠靜容先生和樂崇熙研究員?，F(xiàn)在為北京師范大學(xué)的聘請教授。一種“精益求精”的精神激勵著他把栝樓屬的研究擴大到世界范圍。眾所周知，栝樓屬是藥用價值和經(jīng)濟價值都很高的植物，如天花粉（有抗癌、抗艾滋病作用）即來源于此屬。為了調(diào)查國內(nèi)栝樓屬的藥用植物，他單身一人到 云南、 四川、 貴州、 廣西等地的深山老林。還查閱了 英國、 美國、澳大利亞、 泰國、 馬來西亞、 日本等標本室借來的標本，整理出世界范圍的栝樓屬植物名錄，并在研究過程中，發(fā)現(xiàn)了新種植物，使這一領(lǐng)域的研究達到了國際先進水平。畢業(yè)論文被專家評價為“目前對世界性栝樓屬最全面系統(tǒng)的研究，取得了創(chuàng)造性成果”，并因此獲得北京醫(yī)科大學(xué)特等獎學(xué)金。之后，他回到 中國中醫(yī)科學(xué)院中藥研究所工作，經(jīng)過十幾年的苦心鉆研，他終于繼承和發(fā)揚了老師們的學(xué)術(shù)思想和學(xué)術(shù)成就，使得中國人在栝樓屬方面的研究領(lǐng)先于國際水平，解決了被世界葫蘆科專家C. Jeffrey稱之為“東亞地區(qū)葫蘆科中最難處理的分類學(xué)難題”。

在進行栝樓屬方面的研究時，黃璐琦發(fā)現(xiàn)有很多問題用傳統(tǒng)技術(shù)和方法已經(jīng)無法很好地解決，而分子水平的研究則很可能為這門古老學(xué)科帶來新的生機。1996年，他以《展望分子生物技術(shù)在生藥學(xué)中的應(yīng)用》為題將自己長期以來的思考發(fā)表在《中國中藥雜志》上，文中首次提出了“分子生藥學(xué)”的概念。這篇文章在生藥學(xué)行業(yè)引起了強烈的反響。他創(chuàng)建了國內(nèi)第一個分子生藥學(xué)實驗室并通過 國家中醫(yī)藥管理局三級實驗室驗收。目前，他在分子生藥學(xué)這個領(lǐng)域共培養(yǎng)碩士、博士50多名，營造出團結(jié)進取的氣氛；在倡導(dǎo)和推動分子生藥學(xué)建設(shè)的同時，他謹記“繼承與發(fā)展”這一中藥事業(yè)的永恒主題，在堅持以中醫(yī)理論為指導(dǎo)的前提下，把各個領(lǐng)域的知識引入到中醫(yī)中藥。

2002年，黃璐琦師從中國科學(xué)院自動化所戴汝為院士，把復(fù)雜性科學(xué)的思維和理論引入到中醫(yī)藥的研究中。首次在 國家自然科學(xué)基金復(fù)雜性研究中，立上中醫(yī)藥的課題，從新的角度探討了臟腑關(guān)系、方證相關(guān)等中醫(yī)藥領(lǐng)域的重大問題。尤其，在應(yīng)用復(fù)雜系統(tǒng)的“熵”理論研究“方證相關(guān)”，對推動復(fù)雜性科學(xué)在中醫(yī)藥領(lǐng)域的應(yīng)用起到了重要作用。

主要論文

1.黃璐琦，等. 中藥分子鑒定發(fā)展中的若干問題探討[J].中國中藥雜志，2014（19）；

2.黃璐琦，等. 雙分子標記法的構(gòu)建及在中藥研究中的應(yīng)用[J].中國中藥雜志，2015（02）；

3.黃璐琦，等. 合成生物學(xué)在中藥資源可持續(xù)利用研究中的應(yīng)用[J].藥學(xué)學(xué)報，2014（01）；

4.黃璐琦， 中藥怪象:“洋中藥”橫行[J].中國戰(zhàn)略新興產(chǎn)業(yè)，2014（09）；

5.黃璐琦，等. 第四次全國中藥資源普查試點外業(yè)調(diào)查情況簡報[J].中國現(xiàn)代中藥，2013（07）；

6.黃璐琦，等. 中藥資源發(fā)展的趨勢探討[J].中國中藥雜志，2011（01）；

7.黃璐琦，等. 動物藥材分子鑒定研究策略[J].中國中藥雜志，2011（03）；

8.黃璐琦， 論中藥藥性理論的研究方向[J].中藥與臨床，2011（02）；

9.黃璐琦，等. 系統(tǒng)生物學(xué)方法在藥用植物次生代謝產(chǎn)物研究中的應(yīng)用[J].中國中藥雜志，2010（01）；

10.黃璐琦，等 論中藥用量的特點及研究的關(guān)鍵點[J].中醫(yī)雜志，2009（03）；

11.黃璐琦，等. 探討道地藥材研究的模式生物及模型[J].中國中藥雜志，2009（09）；

12.黃璐琦，等. 我國野生藥材資源管理制度的分析及建議[J].中國中藥雜志，2009（15）；

13.黃璐琦，等. 道地藥材形成的分子機制及其遺傳基礎(chǔ)[J].中國中藥雜志，2008（20）；

14.黃璐琦，郭蘭萍. 環(huán)境脅迫下次生代謝產(chǎn)物的積累及道地藥材的形成[J].中國中藥雜志，2007（04）；

15.黃璐琦，等. 藥用植物受威脅及優(yōu)先保護的綜合評價方法[J].中國中藥雜志，2006（23）；

16.黃璐琦，等. 印度尼西亞傳統(tǒng)醫(yī)藥概況[J].中國中醫(yī)藥信息雜志，2005（04）；

17.黃璐琦，等. 中藥材道地性研究的現(xiàn)代生物學(xué)基礎(chǔ)及模式假說[J].中國中藥雜志，2004（06）；

18.黃璐琦，中藥白芷種質(zhì)資源的系統(tǒng)研究[J].江西中醫(yī)學(xué)院學(xué)報，2004（06）；

19.黃璐琦，等. 中藥材GAP實施的復(fù)雜系統(tǒng)論——生產(chǎn)基地的選建:生態(tài)、文化和經(jīng)濟[J].現(xiàn)代中藥研究與實踐，2003（06）；

20.黃璐琦，等. 中藥材GAP實施的復(fù)雜系統(tǒng)論——中藥材種質(zhì)資源的現(xiàn)狀、問題及方向[J].中國中藥雜志，2002（07）。

出版著作

著作12部，代表作有《分子生藥學(xué)》、《分子生藥學(xué)》（第二版）《分子生藥學(xué)》（第三版）。

獲國家科學(xué)技術(shù)進步二等獎4項（第一完成人3項，第二完成人1項）、省部級一等獎3項、二等獎7項（第一完成人）。先后獲“全國優(yōu)秀科技工作者”、“中國藥學(xué)發(fā)展獎”、“中國青年五四獎?wù)隆薄ⅰ爸袊嗄昕萍吉劇?、“新世紀百千萬人才工程國家級人選”、“中國中醫(yī)藥十大杰出青年”、“衛(wèi)生部有突出貢獻中青年專家”、“中央國家機關(guān)十大杰出青年”、“中國標準創(chuàng)新貢獻獎（突出貢獻獎）”、“北京十大杰出青年”等榮譽稱號，2015年入選中國工程院院士。

2014年 中藥材生產(chǎn)立地條件與土壤微生態(tài)環(huán)境修復(fù)技術(shù)的研究與應(yīng)用 國家科技進步獎二等獎。

2011年 道地藥材形成機理研究及應(yīng)用 國家科技進步獎二等獎。

2008年 珍稀瀕危常用中藥資源五種保護模式的研究 國家科技進步獎二等獎。

2003年 栝樓屬植物的系統(tǒng)演化及其藥材的分子鑒定研究 國家科技進步獎二等獎。

2015年 丹參酮生物合成途徑解析及其合成生物學(xué)研究 中國藥學(xué)會科學(xué)技術(shù)獎一等獎。

2010年 道地藥材研究模式及模型構(gòu)建 中國中西醫(yī)結(jié)合學(xué)會科學(xué)技術(shù)一等獎。

2009年 藥用植物種質(zhì)資源標準化整理、整合及共享試點 中華中醫(yī)藥學(xué)會科學(xué)技術(shù)獎一等獎。