近日,中國中醫(yī)科學(xué)院中藥研究所陳士林團隊和中國科學(xué)院植物研究所漆小泉團隊聯(lián)合中國醫(yī)學(xué)科學(xué)院藥用植物研究所、澳大利亞昆士蘭大學(xué)、美國田納西州大學(xué)健康科學(xué)中心、美國愛荷華州立大學(xué)、澳門大學(xué)、英國桑格研究院和廣藥集團等單位,在著名植物學(xué)雜志《Molecular Plant》發(fā)表丹參全基因組,標(biāo)志著作為常用中藥丹參的遺傳密碼被破譯,為揭示丹參主要藥理活性成分丹參酮和丹參酚酸生物合成及其調(diào)控的分子機制,促進丹參優(yōu)良品種選育提供了重要的遺傳背景基礎(chǔ)。
丹參全基因組解析項目的完成極大促進了丹參生物學(xué)研究,已支撐一批高水平研究成果相繼完成或發(fā)表。陳士林團隊與廣藥集團等企業(yè)形成產(chǎn)學(xué)研互動,為丹參栽培和質(zhì)量控制提供理論基礎(chǔ),為創(chuàng)新性藥物生產(chǎn)提供新的手段。以上系列工作確立了以基因組為突破口的藥用模式植物研究與應(yīng)用新思路,繼靈芝基因組之后再次引發(fā)本草基因組效應(yīng),創(chuàng)建了以藥用模式生物為平臺的中藥研究新理念。
丹參基因組的成功完成,證實混合拼接技術(shù)能顯著改善拼接效果,可有效促進次生代謝產(chǎn)物合成相關(guān)基因簇的鑒定,證明多種測序平臺組合應(yīng)用具有良好的應(yīng)用前景。
該文通訊作者是陳士林和漆小泉研究員。陳士林現(xiàn)任中國中醫(yī)科學(xué)院中藥研究所所長、世界衛(wèi)生組織傳統(tǒng)醫(yī)學(xué)合作中心主任、教育部長江學(xué)者和創(chuàng)新團隊發(fā)展計劃“中藥資源學(xué)”負責(zé)人,首次提出本草基因組的學(xué)術(shù)方向并開展了大量相關(guān)研究工作。漆小泉為中國科學(xué)院“百人計劃”入選者。
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